基于宏基因组学的海带降解菌群微生物多样性及其褐藻多糖降解酶系分析

作者: 周敏 [1] 王海英 [2] 冷凯良 [3] 苗钧魁 [3] 刘小芳 [3] 赵静 [2] 高华 [4]

关键词: 海带 海带降解菌群 宏基因组学 菌群多样性 多糖降解酶

摘要:为系统探讨一组高效海带降解菌群的微生物多样性及其褐藻多糖降解酶系,本实验利用高通量测序技术对该菌群进行组学分析.结果表明,共获得36552330条reads,预测得到105145条基因序列,比对显示此高效海带降解菌群中有75.41%的厚壁菌门(Firmicutes)细菌,优势菌属包括Lachno-clostridium、芽孢杆菌属(Bacillus)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、解硫胺素芽孢杆菌属(Aneurinibacil-lus)、短芽孢杆菌属(Brevibacillus).数据显示有4526个基因编码蛋白质具有海带多糖降解相关酶活性,其中糖苷水解酶(GH)基因数量最多(1520),碳水化合物结合模块(CBM) (764)、碳水化合物酯酶(CE)基因(706)和糖基转移酶(GT) (693)数量次之,多糖裂合酶(PL)基因(107)和辅助氧化还原酶(AA)基因(126)数量较少.在不同的GH基因家族,归属于GH109、GH13、GH18、GH43家族的基因较多.此外还发现了少量的纤维小体组分蛋白基因.本研究发现海带降解菌群中有丰富的褐藻胶裂解酶,纤维素酶,果胶酶,淀粉酶酶系产酶菌,为进一步开发人工高效褐藻降解菌群及褐藻多糖降解酶提供参考.


上一篇: 北太平洋公海秋季鲐鱼生物学特性的初步研究
下一篇: 南黄海绿潮发生时浮游植物群落现状

中国海洋湖沼学会主办  @ 2009  All Rights Reserved
鲁ICP备12003308号-1